回到現實世界快要滿一年，桐人也逐漸適應現實。這天，他和亞絲娜約在東京的皇居見面，兩人談論著現實與虛擬世界的不同。而在那同時，熱門擬真線上游戲《Gun Gail Online》中，卻發生了有人在游戲里受到槍擊，在現實中也同時心臟衰竭的奇特案件，并且類似的案件有二件。政府"假想課"的課員菊岡調二郎找上了桐人，希望他能潛入《Gun Gail Online》與兇手接觸???。