法醫(yī)三澄美琴在非自然死亡原因研究所（簡(jiǎn)稱UDI）工作，研究所坐落在東京都23區(qū)以外的西武藏野市中心，接收全國(guó)各地發(fā)現(xiàn)的死狀異常或因遇害而死的遺體。每年，這里受警察和地方自治體委托處理的遺體大約400具。解剖這些遺體并查明死因就是UDI的職責(zé)。UDI有兩個(gè)團(tuán)隊(duì)——三澄班和中堂班。三澄班的主刀法醫(yī)是美琴，臨床檢查技師是東海林夕子，記錄員是久部六郎。中堂班的主刀醫(yī)生的中堂系，臨床檢查技師是坂本誠(chéng)。而統(tǒng)率這兩支富于個(gè)性的團(tuán)隊(duì)的人是所長(zhǎng)神倉(cāng)保夫。這天，一對(duì)中年夫婦造訪UDI。他們那獨(dú)自生活的兒子高野島渡去世了，警察方面判定是虛血性心臟病。高野島夫婦不認(rèn)可這個(gè)死因，因?yàn)閮鹤雍苣贻p，喜歡登山，身體健康，就算是外行也不相信這樣的人會(huì)有心臟病。他們希望警方能調(diào)查兒子的真正死因，但警方以案件沒(méi)有疑點(diǎn)為由拒絕了。

美琴等人馬上開(kāi)始解剖。結(jié)果發(fā)現(xiàn)心臟沒(méi)異狀，反而發(fā)現(xiàn)了急性腎功能不全的癥狀。美琴懷疑是毒藥致死，進(jìn)行了詳細(xì)調(diào)查，卻不能確定是哪種毒藥導(dǎo)致死亡。這時(shí)，傳來(lái)消息，和高野島一起工作的年輕女同事在高野島去世的第二天也突然死亡，死因不明。為了查明死因，美琴、六郎和東海林一起去了高野島的公寓，遇到了高野島的未婚妻馬場(chǎng)路子。馬場(chǎng)也是高野島遺體的第一發(fā)現(xiàn)人。他們聽(tīng)說(shuō)馬場(chǎng)的工作是開(kāi)發(fā)某種劇毒藥品。因?yàn)闆](méi)人知道的毒藥，所以她開(kāi)發(fā)的是“無(wú)名毒”。在現(xiàn)有的毒藥鑒定體系中，法醫(yī)只能用已知的毒藥進(jìn)行對(duì)比檢測(cè)，所以沒(méi)法檢出“無(wú)名毒”。也就是說(shuō)高野島是被害的。當(dāng)馬場(chǎng)被問(wèn)及高野島死亡時(shí)她是否有不在場(chǎng)證明時(shí)，她竟微笑著說(shuō)她一個(gè)人在家，所以沒(méi)有不在場(chǎng)證明。